MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 19361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	TA	3	6	47	52	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004545	TA	3	6	56	61	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004545	AAAT	2	8	63	70	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004545	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004545	TAT	2	6	161	166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004545	TGA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004545	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004545	T	6	6	215	220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004545	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004545	AAC	3	9	262	270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004545	AGTT	2	8	278	285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004545	TAG	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004545	TAA	2	6	312	317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004545	TAT	3	9	327	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004545	ATT	2	6	348	353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004545	AAT	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004545	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004545	TTAA	2	8	395	402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004545	TAT	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004545	ATT	2	6	462	467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004545	TTA	2	6	494	499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
22	NC_004545	TAG	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
23	NC_004545	A	10	10	553	562	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
24	NC_004545	GGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
25	NC_004545	AAG	2	6	650	655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
26	NC_004545	TTCAG	2	10	704	713	20 %	40 %	20 %	20 %	27904514
27	NC_004545	A	6	6	727	732	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
28	NC_004545	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
29	NC_004545	TAT	2	6	803	808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
30	NC_004545	GAT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
31	NC_004545	AAT	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
32	NC_004545	CAAA	2	8	889	896	75 %	0 %	0 %	25 %	27904514
33	NC_004545	T	7	7	904	910	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
34	NC_004545	TGT	2	6	918	923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904514
35	NC_004545	AGG	2	6	945	950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
36	NC_004545	TA	3	6	958	963	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
37	NC_004545	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
38	NC_004545	AGG	2	6	981	986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27904514
39	NC_004545	C	7	7	1072	1078	0 %	0 %	0 %	100 %	27904514
40	NC_004545	TAA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
41	NC_004545	A	6	6	1214	1219	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
42	NC_004545	A	6	6	1236	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
43	NC_004545	A	7	7	1246	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
44	NC_004545	TATT	2	8	1257	1264	25 %	75 %	0 %	0 %	27904514
45	NC_004545	TAA	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
46	NC_004545	AT	3	6	1387	1392	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
47	NC_004545	AACT	2	8	1529	1536	50 %	25 %	0 %	25 %	27904514
48	NC_004545	AAGT	2	8	1542	1549	50 %	25 %	25 %	0 %	27904514
49	NC_004545	T	9	9	1560	1568	0 %	100 %	0 %	0 %	27904514
50	NC_004545	AAAT	2	8	1577	1584	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
51	NC_004545	TAC	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904514
52	NC_004545	GAA	2	6	1600	1605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
53	NC_004545	GCT	3	9	1606	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27904514
54	NC_004545	TTA	2	6	1621	1626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
55	NC_004545	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
56	NC_004545	GGT	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27904514
57	NC_004545	TGA	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
58	NC_004545	AAC	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27904514
59	NC_004545	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
60	NC_004545	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
61	NC_004545	AAAT	2	8	1973	1980	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
62	NC_004545	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
63	NC_004545	AAAT	2	8	2018	2025	75 %	25 %	0 %	0 %	27904514
64	NC_004545	TACTC	2	10	2026	2035	20 %	40 %	0 %	40 %	27904514
65	NC_004545	A	6	6	2047	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
66	NC_004545	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904514
67	NC_004545	A	6	6	2145	2150	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
68	NC_004545	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904514
69	NC_004545	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904514
70	NC_004545	TAAAA	2	10	2181	2190	80 %	20 %	0 %	0 %	27904514
71	NC_004545	A	6	6	2187	2192	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
72	NC_004545	AGT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904514
73	NC_004545	AT	3	6	2317	2322	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
74	NC_004545	A	10	10	2325	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	27904514
75	NC_004545	TA	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	27904514
76	NC_004545	T	8	8	2350	2357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004545	T	6	6	2370	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004545	TAA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004545	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004545	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004545	T	7	7	2459	2465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004545	T	6	6	2469	2474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004545	AAAT	2	8	2476	2483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004545	ATTTTT	2	12	2511	2522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004545	AT	3	6	2530	2535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004545	TA	3	6	2541	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004545	ATG	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004545	TA	3	6	2592	2597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004545	TAT	2	6	2612	2617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004545	A	6	6	2651	2656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004545	ATC	3	9	2708	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904515
92	NC_004545	TCA	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904515
93	NC_004545	T	7	7	2810	2816	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
94	NC_004545	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
95	NC_004545	TACAA	2	10	2874	2883	60 %	20 %	0 %	20 %	27904515
96	NC_004545	CAAA	2	8	2888	2895	75 %	0 %	0 %	25 %	27904515
97	NC_004545	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
98	NC_004545	TAA	3	9	2931	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
99	NC_004545	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	27904515
100	NC_004545	TTTG	2	8	2998	3005	0 %	75 %	25 %	0 %	27904515
101	NC_004545	T	7	7	3008	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
102	NC_004545	ATTT	2	8	3054	3061	25 %	75 %	0 %	0 %	27904515
103	NC_004545	AATTA	2	10	3090	3099	60 %	40 %	0 %	0 %	27904515
104	NC_004545	TAA	2	6	3155	3160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
105	NC_004545	T	6	6	3161	3166	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
106	NC_004545	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	27904515
107	NC_004545	TTA	2	6	3274	3279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
108	NC_004545	ATT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
109	NC_004545	ATT	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904515
110	NC_004545	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27904515
111	NC_004545	TAA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904515
112	NC_004545	TTTTAT	2	12	3435	3446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904515
113	NC_004545	ATT	2	6	3511	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004545	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004545	TGT	2	6	3567	3572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904516
116	NC_004545	AGC	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27904516
117	NC_004545	AGC	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27904516
118	NC_004545	CA	3	6	3694	3699	50 %	0 %	0 %	50 %	27904516
119	NC_004545	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	27904516
120	NC_004545	TA	3	6	3759	3764	50 %	50 %	0 %	0 %	27904516
121	NC_004545	TA	3	6	3778	3783	50 %	50 %	0 %	0 %	27904516
122	NC_004545	TA	3	6	3797	3802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004545	TTA	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004545	TA	4	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004545	AT	3	6	3871	3876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004545	AATTT	2	10	3877	3886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004545	T	7	7	3884	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004545	TAA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004545	TTG	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904517
130	NC_004545	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
131	NC_004545	AAATTA	2	12	4099	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
132	NC_004545	A	9	9	4112	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
133	NC_004545	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
134	NC_004545	ACA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27904517
135	NC_004545	A	6	6	4153	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
136	NC_004545	GAAAAA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27904517
137	NC_004545	AGCA	2	8	4216	4223	50 %	0 %	25 %	25 %	27904517
138	NC_004545	ATA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
139	NC_004545	AGA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27904517
140	NC_004545	A	8	8	4367	4374	100 %	0 %	0 %	0 %	27904517
141	NC_004545	AT	3	6	4504	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	27904518
142	NC_004545	AAT	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904518
143	NC_004545	ATT	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904518
144	NC_004545	AATTT	2	10	4530	4539	40 %	60 %	0 %	0 %	27904518
145	NC_004545	TTTA	2	8	4571	4578	25 %	75 %	0 %	0 %	27904518
146	NC_004545	TGT	2	6	4587	4592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904518
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